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KPS® 绵羊50K芯片

绵羊50K SNP分型芯片由orange平台官网开发,是一款中高通量SNP分型芯片。利用illumina平台定制,包含中外17个代表性绵羊物种的生产性能相关的高效SNP,共计56546个位点。

产品特点


KPS® 绵羊50K 芯片位点,均匀覆盖羊全基因组,涵盖重要性状位点,包括如羊角、体重、肉质、繁殖和疾病等重要性状等, 适用于基因的筛选和定位、基因组育种、品种鉴定、亲子鉴定等。

 

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芯片数据来源

性状相关SNP数据利用已有GWAS 等关联分析研究结果,涵盖羊角、体重、肉质、繁殖和疾病等经济性状的SNP位点。

优选KPS Oar SNP 600K芯片位点设置为全基因组覆盖位点,合计选点18K。

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芯片位点设计

优化设计:全基因组平均分布。

通用性:加入重要性状相关SNP位点,并引入KPS Oar SNP 600K芯片18K位点,确保互相 Imputation。

差异性:种间和种内亚群差异位点(样本分为 3 个类群,蒙古羊群组、藏羊群组、 外国羊群组),合计选点 2.5K。

功能相关性:24K位点与羊角、体重、肉质、繁殖和疾病等经济性状相关。

通量适中:在全基因组选择育种实践中应用性价比高。


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